治疗腹泻，最重要的是对症下药。腹泻分为感染性和非感染性两类，感染性腹泻由细菌或病毒等引起;非感染性腹泻多由饮食不节、食物过敏、生活规律改变、气候突变等原因引起。因此，一定要分清腹泻的类型，然后进行对因治疗。
对感染性腹泻，首先要分清是细菌性的还是病毒性的。如果是细菌性的，可在医生指导下，针对引起腹泻的病菌种类，选用相应敏感的抗生素进行治疗;如果是病毒性的，使用抗生素则无效，可采用中医辨证论治或对症治疗。
对非感染性腹泻，可采用中医辨证论治和饮食疗法，服用一些助消化的药物。
(1)吸附药及胃肠道黏膜保护剂
药用活性炭、白陶土、鞣酸蛋白、次碳酸铋、双八面体蒙托石(思密达)等。常用于治疗消化不良、急性肠炎、溃疡性结肠炎等引起的腹泻。
这些药物口服到大肠后，可通过吸附或收敛作用减少肠内容物对肠壁的刺激，或形成保护膜，减少肠黏膜渗出而发挥止泻作用。有的也能吸收大便中的水分，使粪便稍微成形。药物本身无杀菌、抗毒作用。因其作用不强，对严重腹泻疗效稍差。
以上药物宜空腹服用，如需同时服用其他药物，应间隔一段时间。有呕吐者不宜使用。
(2)通过影响肠道运动而止泻的药
地兰诺酯、洛哌丁胺(易蒙停)、复方樟脑酊等。这些药物可用于急、慢性腹泻，对局限性肠炎、溃疡性肠炎、放射病引起的慢性腹泻亦有效，其止泻作用强而迅速。
主要作用于肠壁，直接抑制胃肠平滑肌的收缩，抑制肠蠕动，从而达到减少排便次数的目的。但必须注意的是，1岁以下婴儿、孕妇和哺乳期妇女不宜使用;肝功能不全者应慎用;急性细菌性痢疾、急性溃疡性结肠炎和伪膜性肠炎者禁用。
(3)解痉止痛剂
阿托品、山莨菪碱(654-2)、普鲁本辛等药。有选择性解除痉挛的作用，并能扩张血管、改善微循环，治疗感染性休克，常用于胃肠绞痛。青光眼、脑出血者禁用。
(4)调节肠道菌群药
多为一些人体正常菌群中的有益菌的活菌制剂。常见的有双歧杆菌、嗜酸性乳酸杆菌、酪酸菌、地衣芽孢菌无毒菌株等。可用于急慢性肠炎、消化不良、肠道菌群失调、菌痢等。
应用后能大量补充肠道内正常菌群的数量，并能促进其增殖，以纠正菌群失调，抑制肠道内致病菌的生长。但不能与抗菌药物同服，应间隔半小时以上。
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