除常见的心理、神经系统、心血管系统、内分泌系统、医源性等因素可导致阳痿外，尚有许多疾病也常伴发有较高的阳痿发生率，或是不可避免地发生阳痿，如阴茎硬结症、阴茎肿瘤、肝肾功能不全、尿道下裂、尿道上裂、包茎、镰状细胞性贫血、阴茎异常勃起等等。
阴茎硬结症
阴茎硬结症又称阴茎纤维性海绵体炎，常位于海绵体部位，多为背侧根部可触及的结节状或条索状硬结，单发或多发，严重时伴有阴茎弯曲畸形，此类患者即使不伴有阳痿，也有可能因为勃起时疼痛或阴茎弯曲畸形而不能获得满意的性生活。
尿道上、下裂
尿道上、下裂以尿道开口位置异常、阴茎弯曲畸形和帽状包皮为典型表现，轻度的龟头型尿道下裂一般不会影响到勃起功能，但阴茎体中间型、阴茎体近端型或更严重的尿道下裂则可因为纤维索带的牵拉而不能伸直勃起，即使此类患者已经手术矫正，也可能因为阴茎的血管神经受到不可避免的损伤而发生阳痿。
包茎
包茎患者因包皮口纤维狭窄环的限制导致阴茎多不能完全勃起，即使勃起也有形成包茎嵌顿而导致阴茎水肿、感染，甚至坏死的可能。此时应及时行包皮环切术矫正畸形，术后绝大多数不伴有其他疾病的患者可获得正常的勃起功能。
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