1、由于淋病是一种性传播疾病，在患病后不去正规医院，专找游医、小门诊，使用的药物疗效不当、剂量不足，致使症状暂时缓解，但未达到彻底治疗。长时间就轻易使淋球菌产生耐药性，或病菌隐藏于泌尿生殖系统的腺体，引起前列腺炎、精囊炎、附睾炎、宫颈炎或附件炎等，并造成尿道黏膜损伤。
2、用药不足或疗程不够：有的淋病患者，由于心理上有羞愧感，不愿到医院就诊，自行盲目用药或到一些小诊所治疗，症状消失了，自以为病好了，但之后淋病反复发作，这主要是由于治疗不彻底，患者依然是病菌携带者便中断治疗，以致使用的药物剂量不足或疗程不够或未彻底治愈，从而造成迁延不愈。
3、性伴侣未同时治疗很多患者对性伴侣隐瞒病史，特别是夫妻之间还继续过性生活，使病菌传染给对方，伴侣在不知情的情况下疏于治疗。因此固然原患者进行了治疗，但与性伴侣之间仍反复交叉感染，造成症状时好时坏。
4、精神因素影响在临床上这种患者为数不少。染病后由于精神上过度紧张和恐惧，治疗上谨慎小心，害怕被别人发现自己的“丑事”，对很稍微出现的不适症状表现得“很重”，加剧了泌尿生殖系统上皮细胞分泌功能的失调。
5、合并其他感染临床上常见的有衣原体、支原体及表皮葡萄球菌感染，固然淋病治愈，但上述微生物仍潜伏体内，使病情迁延难治。
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